Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRAPPC9Q96Q05 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TRAPPC9Q96Q05 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms