Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
UBXN4Q92575 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
UBXN4Q92575 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
UBXN4Q92575 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
UBXN4Q92575 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
UBXN4Q92575 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
UBXN4Q92575 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
UBXN4Q92575 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
UBXN4Q92575 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
UBXN4Q92575 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
UBXN4Q92575 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
UBXN4Q92575 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
UBXN4Q92575 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
UBXN4Q92575 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
UBXN4Q92575 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
UBXN4Q92575 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
UBXN4Q92575 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
UBXN4Q92575 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
UBXN4Q92575 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
UBXN4Q92575 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
UBXN4Q92575 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
UBXN4Q92575 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
UBXN4Q92575 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
UBXN4Q92575 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
UBXN4Q92575 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
UBXN4Q92575 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
UBXN4Q92575 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
UBXN4Q92575 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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