Protein–RNA interactions for Protein: Q70JA7

CHSY3, Chondroitin sulfate synthase 3, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY3Q70JA7 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHSY3Q70JA7 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHSY3Q70JA7 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHSY3Q70JA7 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHSY3Q70JA7 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
CHSY3Q70JA7 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHSY3Q70JA7 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHSY3Q70JA7 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 250.5 ms