Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
ANKRD39Q53RE8 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ANKRD39Q53RE8 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 230.2 ms