Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TPRNQ4KMQ1 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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