Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

Predictions only

Length 1,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPN21Q16825 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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