Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HIF1AQ16665 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms