Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FSCN1Q16658 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FSCN1Q16658 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FSCN1Q16658 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FSCN1Q16658 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FSCN1Q16658 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
FSCN1Q16658 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
FSCN1Q16658 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FSCN1Q16658 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FSCN1Q16658 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FSCN1Q16658 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FSCN1Q16658 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FSCN1Q16658 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FSCN1Q16658 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FSCN1Q16658 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FSCN1Q16658 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FSCN1Q16658 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FSCN1Q16658 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FSCN1Q16658 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FSCN1Q16658 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FSCN1Q16658 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
FSCN1Q16658 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FSCN1Q16658 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FSCN1Q16658 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
FSCN1Q16658 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FSCN1Q16658 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FSCN1Q16658 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FSCN1Q16658 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FSCN1Q16658 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.5 ms