Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
HMGN3Q15651 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC-2.16□□□□□ -2.75
HMGN3Q15651 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-2.16□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC-2.17□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC-2.17□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC-2.18□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
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