Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TAF1CQ15572 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TAF1CQ15572 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TAF1CQ15572 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TAF1CQ15572 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
TAF1CQ15572 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
TAF1CQ15572 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
TAF1CQ15572 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TAF1CQ15572 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TAF1CQ15572 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TAF1CQ15572 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TAF1CQ15572 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TAF1CQ15572 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TAF1CQ15572 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
TAF1CQ15572 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TAF1CQ15572 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TAF1CQ15572 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
TAF1CQ15572 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TAF1CQ15572 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
TAF1CQ15572 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TAF1CQ15572 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TAF1CQ15572 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TAF1CQ15572 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TAF1CQ15572 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TAF1CQ15572 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TAF1CQ15572 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TAF1CQ15572 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
TAF1CQ15572 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
TAF1CQ15572 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TAF1CQ15572 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TAF1CQ15572 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TAF1CQ15572 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TAF1CQ15572 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TAF1CQ15572 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TAF1CQ15572 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TAF1CQ15572 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TAF1CQ15572 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TAF1CQ15572 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TAF1CQ15572 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
TAF1CQ15572 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
TAF1CQ15572 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TAF1CQ15572 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TAF1CQ15572 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TAF1CQ15572 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TAF1CQ15572 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TAF1CQ15572 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TAF1CQ15572 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TAF1CQ15572 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
TAF1CQ15572 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
TAF1CQ15572 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
TAF1CQ15572 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
TAF1CQ15572 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TAF1CQ15572 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TAF1CQ15572 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TAF1CQ15572 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
TAF1CQ15572 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
TAF1CQ15572 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TAF1CQ15572 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TAF1CQ15572 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TAF1CQ15572 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TAF1CQ15572 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
TAF1CQ15572 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TAF1CQ15572 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TAF1CQ15572 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TAF1CQ15572 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TAF1CQ15572 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
TAF1CQ15572 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
TAF1CQ15572 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
TAF1CQ15572 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TAF1CQ15572 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TAF1CQ15572 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TAF1CQ15572 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TAF1CQ15572 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TAF1CQ15572 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TAF1CQ15572 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TAF1CQ15572 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TAF1CQ15572 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TAF1CQ15572 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TAF1CQ15572 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TAF1CQ15572 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TAF1CQ15572 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TAF1CQ15572 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TAF1CQ15572 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TAF1CQ15572 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TAF1CQ15572 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
TAF1CQ15572 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TAF1CQ15572 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TAF1CQ15572 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TAF1CQ15572 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TAF1CQ15572 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TAF1CQ15572 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TAF1CQ15572 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TAF1CQ15572 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TAF1CQ15572 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TAF1CQ15572 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TAF1CQ15572 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TAF1CQ15572 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TAF1CQ15572 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TAF1CQ15572 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TAF1CQ15572 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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