Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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SIX1Q15475 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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SIX1Q15475 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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SIX1Q15475 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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SIX1Q15475 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
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SIX1Q15475 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
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