Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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