Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
HERC3Q15034 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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