Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
R3HDM1Q15032 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
R3HDM1Q15032 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
R3HDM1Q15032 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
R3HDM1Q15032 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
R3HDM1Q15032 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
R3HDM1Q15032 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
R3HDM1Q15032 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
R3HDM1Q15032 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
R3HDM1Q15032 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
R3HDM1Q15032 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
R3HDM1Q15032 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.1 ms