Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NCAPHQ15003 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NCAPHQ15003 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
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