Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SCARB2Q14108 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SCARB2Q14108 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SCARB2Q14108 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SCARB2Q14108 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SCARB2Q14108 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SCARB2Q14108 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SCARB2Q14108 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SCARB2Q14108 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SCARB2Q14108 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SCARB2Q14108 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SCARB2Q14108 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SCARB2Q14108 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SCARB2Q14108 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SCARB2Q14108 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SCARB2Q14108 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SCARB2Q14108 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SCARB2Q14108 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SCARB2Q14108 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SCARB2Q14108 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SCARB2Q14108 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SCARB2Q14108 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SCARB2Q14108 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SCARB2Q14108 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SCARB2Q14108 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SCARB2Q14108 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SCARB2Q14108 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SCARB2Q14108 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SCARB2Q14108 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SCARB2Q14108 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SCARB2Q14108 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SCARB2Q14108 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SCARB2Q14108 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SCARB2Q14108 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SCARB2Q14108 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SCARB2Q14108 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SCARB2Q14108 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SCARB2Q14108 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SCARB2Q14108 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SCARB2Q14108 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SCARB2Q14108 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SCARB2Q14108 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
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