Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GTF2H2Q13888 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GTF2H2Q13888 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
GTF2H2Q13888 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GTF2H2Q13888 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GTF2H2Q13888 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
GTF2H2Q13888 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GTF2H2Q13888 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GTF2H2Q13888 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GTF2H2Q13888 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GTF2H2Q13888 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GTF2H2Q13888 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GTF2H2Q13888 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GTF2H2Q13888 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GTF2H2Q13888 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GTF2H2Q13888 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GTF2H2Q13888 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GTF2H2Q13888 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GTF2H2Q13888 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GTF2H2Q13888 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GTF2H2Q13888 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GTF2H2Q13888 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GTF2H2Q13888 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GTF2H2Q13888 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GTF2H2Q13888 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GTF2H2Q13888 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GTF2H2Q13888 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms