Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms