Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC-1.76□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.77□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC-1.77□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SPTAN1Q13813 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SPTAN1Q13813 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SPTAN1Q13813 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SPTAN1Q13813 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SPTAN1Q13813 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SPTAN1Q13813 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SPTAN1Q13813 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SPTAN1Q13813 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SPTAN1Q13813 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SPTAN1Q13813 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SPTAN1Q13813 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SPTAN1Q13813 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SPTAN1Q13813 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SPTAN1Q13813 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SPTAN1Q13813 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SPTAN1Q13813 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SPTAN1Q13813 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC-1.8□□□□□ -2.7
SPTAN1Q13813 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SPTAN1Q13813 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SPTAN1Q13813 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SPTAN1Q13813 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SPTAN1Q13813 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SPTAN1Q13813 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SPTAN1Q13813 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SPTAN1Q13813 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SPTAN1Q13813 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SPTAN1Q13813 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
SPTAN1Q13813 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
SPTAN1Q13813 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
SPTAN1Q13813 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
SPTAN1Q13813 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
SPTAN1Q13813 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC-1.81□□□□□ -2.7
SPTAN1Q13813 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
SPTAN1Q13813 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms