Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
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ITGA9Q13797 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
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ITGA9Q13797 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
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ITGA9Q13797 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
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ITGA9Q13797 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
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ITGA9Q13797 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
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ITGA9Q13797 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ITGA9Q13797 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
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ITGA9Q13797 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ITGA9Q13797 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ITGA9Q13797 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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ITGA9Q13797 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ITGA9Q13797 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ITGA9Q13797 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
ITGA9Q13797 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ITGA9Q13797 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ITGA9Q13797 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ITGA9Q13797 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ITGA9Q13797 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ITGA9Q13797 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ITGA9Q13797 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ITGA9Q13797 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ITGA9Q13797 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ITGA9Q13797 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ITGA9Q13797 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ITGA9Q13797 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ITGA9Q13797 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ITGA9Q13797 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ITGA9Q13797 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ITGA9Q13797 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ITGA9Q13797 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ITGA9Q13797 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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