Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
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TOP3AQ13472 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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TOP3AQ13472 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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TOP3AQ13472 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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TOP3AQ13472 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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TOP3AQ13472 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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TOP3AQ13472 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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TOP3AQ13472 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TOP3AQ13472 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
TOP3AQ13472 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TOP3AQ13472 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
TOP3AQ13472 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
TOP3AQ13472 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TOP3AQ13472 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TOP3AQ13472 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TOP3AQ13472 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TOP3AQ13472 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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