Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
ATMQ13315 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
ATMQ13315 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
ATMQ13315 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
ATMQ13315 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
ATMQ13315 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
ATMQ13315 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
ATMQ13315 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
ATMQ13315 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
ATMQ13315 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
ATMQ13315 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
ATMQ13315 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
ATMQ13315 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
ATMQ13315 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
ATMQ13315 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
ATMQ13315 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
ATMQ13315 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
ATMQ13315 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
ATMQ13315 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
ATMQ13315 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
ATMQ13315 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
ATMQ13315 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC-1.88□□□□□ -2.71
ATMQ13315 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
ATMQ13315 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
ATMQ13315 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC-1.88□□□□□ -2.71
ATMQ13315 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
ATMQ13315 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
ATMQ13315 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
ATMQ13315 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
ATMQ13315 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
ATMQ13315 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
ATMQ13315 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC-1.88□□□□□ -2.71
ATMQ13315 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
ATMQ13315 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
ATMQ13315 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
ATMQ13315 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
ATMQ13315 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
ATMQ13315 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
ATMQ13315 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
ATMQ13315 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC-1.89□□□□□ -2.71
ATMQ13315 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
ATMQ13315 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
ATMQ13315 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
ATMQ13315 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
ATMQ13315 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC-1.89□□□□□ -2.71
ATMQ13315 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
ATMQ13315 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
ATMQ13315 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
ATMQ13315 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
ATMQ13315 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
ATMQ13315 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
ATMQ13315 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
ATMQ13315 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
ATMQ13315 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
ATMQ13315 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
ATMQ13315 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
ATMQ13315 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
ATMQ13315 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
ATMQ13315 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
ATMQ13315 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
ATMQ13315 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
ATMQ13315 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
ATMQ13315 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
ATMQ13315 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
ATMQ13315 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
ATMQ13315 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
ATMQ13315 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
ATMQ13315 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
ATMQ13315 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC-1.91□□□□□ -2.71
ATMQ13315 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC-1.91□□□□□ -2.71
ATMQ13315 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC-1.91□□□□□ -2.71
ATMQ13315 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
ATMQ13315 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
ATMQ13315 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
ATMQ13315 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC-1.91□□□□□ -2.72
ATMQ13315 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC-1.91□□□□□ -2.72
ATMQ13315 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
ATMQ13315 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
ATMQ13315 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
ATMQ13315 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
ATMQ13315 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
ATMQ13315 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
ATMQ13315 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
ATMQ13315 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
ATMQ13315 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
ATMQ13315 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
ATMQ13315 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
ATMQ13315 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
ATMQ13315 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC-1.92□□□□□ -2.72
ATMQ13315 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
ATMQ13315 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC-1.92□□□□□ -2.72
ATMQ13315 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
ATMQ13315 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
ATMQ13315 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
ATMQ13315 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC-1.93□□□□□ -2.72
ATMQ13315 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
ATMQ13315 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
ATMQ13315 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
ATMQ13315 RNU6-1044P-201ENST00000384755 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
ATMQ13315 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
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