Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SEMA3FQ13275 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
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SEMA3FQ13275 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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SEMA3FQ13275 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SEMA3FQ13275 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SEMA3FQ13275 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEMA3FQ13275 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEMA3FQ13275 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEMA3FQ13275 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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SEMA3FQ13275 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SEMA3FQ13275 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SEMA3FQ13275 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SEMA3FQ13275 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEMA3FQ13275 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEMA3FQ13275 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEMA3FQ13275 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEMA3FQ13275 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEMA3FQ13275 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SEMA3FQ13275 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SEMA3FQ13275 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SEMA3FQ13275 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SEMA3FQ13275 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SEMA3FQ13275 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SEMA3FQ13275 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SEMA3FQ13275 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SEMA3FQ13275 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SEMA3FQ13275 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SEMA3FQ13275 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SEMA3FQ13275 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SEMA3FQ13275 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SEMA3FQ13275 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SEMA3FQ13275 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SEMA3FQ13275 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SEMA3FQ13275 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SEMA3FQ13275 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SEMA3FQ13275 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SEMA3FQ13275 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3FQ13275 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3FQ13275 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3FQ13275 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3FQ13275 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3FQ13275 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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