Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
STRN3Q13033 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
STRN3Q13033 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 239.9 ms