Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHD3Q12873 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHD3Q12873 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHD3Q12873 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHD3Q12873 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHD3Q12873 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHD3Q12873 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHD3Q12873 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHD3Q12873 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHD3Q12873 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHD3Q12873 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHD3Q12873 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHD3Q12873 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHD3Q12873 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHD3Q12873 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHD3Q12873 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHD3Q12873 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHD3Q12873 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHD3Q12873 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHD3Q12873 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHD3Q12873 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHD3Q12873 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHD3Q12873 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHD3Q12873 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHD3Q12873 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHD3Q12873 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHD3Q12873 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHD3Q12873 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHD3Q12873 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CHD3Q12873 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CHD3Q12873 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CHD3Q12873 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CHD3Q12873 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CHD3Q12873 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CHD3Q12873 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CHD3Q12873 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
CHD3Q12873 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CHD3Q12873 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CHD3Q12873 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CHD3Q12873 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms