Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
CENPFP49454 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
CENPFP49454 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
CENPFP49454 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
CENPFP49454 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
CENPFP49454 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
CENPFP49454 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
CENPFP49454 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
CENPFP49454 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
CENPFP49454 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
CENPFP49454 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
CENPFP49454 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
CENPFP49454 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
CENPFP49454 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
CENPFP49454 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
CENPFP49454 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.87
CENPFP49454 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.87
CENPFP49454 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.87
CENPFP49454 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.87
CENPFP49454 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
CENPFP49454 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
CENPFP49454 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
CENPFP49454 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
CENPFP49454 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
CENPFP49454 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
CENPFP49454 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
CENPFP49454 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
CENPFP49454 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
CENPFP49454 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
CENPFP49454 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
CENPFP49454 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
CENPFP49454 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
CENPFP49454 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
CENPFP49454 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
CENPFP49454 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
CENPFP49454 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
CENPFP49454 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
CENPFP49454 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
CENPFP49454 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
CENPFP49454 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
CENPFP49454 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
CENPFP49454 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
CENPFP49454 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
CENPFP49454 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-2.93□□□□□ -2.88
CENPFP49454 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
CENPFP49454 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
CENPFP49454 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
CENPFP49454 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
CENPFP49454 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
CENPFP49454 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
CENPFP49454 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
CENPFP49454 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
CENPFP49454 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
CENPFP49454 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
CENPFP49454 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC-2.94□□□□□ -2.88
CENPFP49454 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
CENPFP49454 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
CENPFP49454 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
CENPFP49454 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
CENPFP49454 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
CENPFP49454 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
CENPFP49454 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
CENPFP49454 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
CENPFP49454 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
CENPFP49454 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
CENPFP49454 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
CENPFP49454 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
CENPFP49454 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
CENPFP49454 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
CENPFP49454 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
CENPFP49454 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
CENPFP49454 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC-2.95□□□□□ -2.88
CENPFP49454 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
CENPFP49454 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
CENPFP49454 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
CENPFP49454 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
CENPFP49454 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
CENPFP49454 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC-2.95□□□□□ -2.88
CENPFP49454 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
CENPFP49454 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
CENPFP49454 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
CENPFP49454 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
CENPFP49454 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
CENPFP49454 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
CENPFP49454 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
CENPFP49454 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
CENPFP49454 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
CENPFP49454 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
CENPFP49454 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
CENPFP49454 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
CENPFP49454 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
CENPFP49454 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
CENPFP49454 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
CENPFP49454 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
CENPFP49454 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
CENPFP49454 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.89
CENPFP49454 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
CENPFP49454 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
CENPFP49454 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
CENPFP49454 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 218.1 ms