Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPRMP28827 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPRMP28827 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPRMP28827 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPRMP28827 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPRMP28827 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPRMP28827 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPRMP28827 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPRMP28827 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPRMP28827 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPRMP28827 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPRMP28827 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPRMP28827 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPRMP28827 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPRMP28827 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
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PTPRMP28827 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPRMP28827 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPRMP28827 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPRMP28827 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPRMP28827 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPRMP28827 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPRMP28827 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPRMP28827 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPRMP28827 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPRMP28827 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPRMP28827 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPRMP28827 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPRMP28827 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPRMP28827 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPRMP28827 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
PTPRMP28827 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
PTPRMP28827 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
PTPRMP28827 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
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PTPRMP28827 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
PTPRMP28827 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
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PTPRMP28827 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
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PTPRMP28827 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPRMP28827 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPRMP28827 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPRMP28827 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPRMP28827 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPRMP28827 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPRMP28827 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPRMP28827 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPRMP28827 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPRMP28827 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPRMP28827 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPRMP28827 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPRMP28827 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
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