Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBQLN4Q9NRR5 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBQLN4Q9NRR5 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBQLN4Q9NRR5 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBQLN4Q9NRR5 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBQLN4Q9NRR5 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBQLN4Q9NRR5 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBQLN4Q9NRR5 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBQLN4Q9NRR5 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBQLN4Q9NRR5 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBQLN4Q9NRR5 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
UBQLN4Q9NRR5 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
UBQLN4Q9NRR5 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
UBQLN4Q9NRR5 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
UBQLN4Q9NRR5 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
UBQLN4Q9NRR5 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
UBQLN4Q9NRR5 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
UBQLN4Q9NRR5 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
UBQLN4Q9NRR5 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
UBQLN4Q9NRR5 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
UBQLN4Q9NRR5 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
UBQLN4Q9NRR5 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
UBQLN4Q9NRR5 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
UBQLN4Q9NRR5 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
UBQLN4Q9NRR5 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
UBQLN4Q9NRR5 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.1 ms