Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
CIPCQ9C0C6 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
CIPCQ9C0C6 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CIPCQ9C0C6 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CIPCQ9C0C6 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CIPCQ9C0C6 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CIPCQ9C0C6 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CIPCQ9C0C6 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CIPCQ9C0C6 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CIPCQ9C0C6 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CIPCQ9C0C6 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CIPCQ9C0C6 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CIPCQ9C0C6 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CIPCQ9C0C6 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CIPCQ9C0C6 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CIPCQ9C0C6 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
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