Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC-1.65□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.65□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC-1.7□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
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