Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
UBXN4Q92575 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
UBXN4Q92575 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC2□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
UBXN4Q92575 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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