Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
NLRC3Q7RTR2 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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