Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CSPP1Q1MSJ5 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CSPP1Q1MSJ5 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CSPP1Q1MSJ5 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CSPP1Q1MSJ5 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CSPP1Q1MSJ5 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CSPP1Q1MSJ5 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CSPP1Q1MSJ5 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CSPP1Q1MSJ5 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CSPP1Q1MSJ5 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CSPP1Q1MSJ5 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CSPP1Q1MSJ5 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CSPP1Q1MSJ5 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CSPP1Q1MSJ5 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CSPP1Q1MSJ5 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CSPP1Q1MSJ5 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CSPP1Q1MSJ5 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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