Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MSMPQ1L6U9 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MSMPQ1L6U9 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MSMPQ1L6U9 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MSMPQ1L6U9 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MSMPQ1L6U9 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MSMPQ1L6U9 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MSMPQ1L6U9 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
MSMPQ1L6U9 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MSMPQ1L6U9 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
MSMPQ1L6U9 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
MSMPQ1L6U9 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MSMPQ1L6U9 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
MSMPQ1L6U9 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MSMPQ1L6U9 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MSMPQ1L6U9 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
MSMPQ1L6U9 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
MSMPQ1L6U9 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
MSMPQ1L6U9 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
MSMPQ1L6U9 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MSMPQ1L6U9 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MSMPQ1L6U9 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MSMPQ1L6U9 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MSMPQ1L6U9 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MSMPQ1L6U9 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MSMPQ1L6U9 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MSMPQ1L6U9 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MSMPQ1L6U9 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MSMPQ1L6U9 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
MSMPQ1L6U9 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MSMPQ1L6U9 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
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