Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-1□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-1□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RTL8BQ17RB0 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
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RTL8BQ17RB0 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
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RTL8BQ17RB0 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
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