Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPROQ16827 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
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