Protein–RNA interactions for Protein: Q16650

TBR1, T-box brain protein 1, humanhuman

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBR1Q16650 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TBR1Q16650 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TBR1Q16650 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TBR1Q16650 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TBR1Q16650 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TBR1Q16650 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
TBR1Q16650 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TBR1Q16650 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TBR1Q16650 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TBR1Q16650 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TBR1Q16650 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TBR1Q16650 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TBR1Q16650 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TBR1Q16650 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TBR1Q16650 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TBR1Q16650 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TBR1Q16650 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TBR1Q16650 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TBR1Q16650 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TBR1Q16650 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TBR1Q16650 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
TBR1Q16650 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TBR1Q16650 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TBR1Q16650 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TBR1Q16650 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TBR1Q16650 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TBR1Q16650 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TBR1Q16650 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TBR1Q16650 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TBR1Q16650 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TBR1Q16650 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TBR1Q16650 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TBR1Q16650 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TBR1Q16650 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
TBR1Q16650 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TBR1Q16650 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
TBR1Q16650 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
TBR1Q16650 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
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