Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
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VPS72Q15906 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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VPS72Q15906 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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VPS72Q15906 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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