Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
POLD3Q15054 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
POLD3Q15054 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
POLD3Q15054 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
POLD3Q15054 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
POLD3Q15054 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
POLD3Q15054 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
POLD3Q15054 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
POLD3Q15054 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
POLD3Q15054 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
POLD3Q15054 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
POLD3Q15054 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
POLD3Q15054 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
POLD3Q15054 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
POLD3Q15054 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
POLD3Q15054 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
POLD3Q15054 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
POLD3Q15054 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
POLD3Q15054 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
POLD3Q15054 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
POLD3Q15054 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
POLD3Q15054 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
POLD3Q15054 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
POLD3Q15054 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
POLD3Q15054 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
POLD3Q15054 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
POLD3Q15054 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
POLD3Q15054 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
POLD3Q15054 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
POLD3Q15054 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
POLD3Q15054 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
POLD3Q15054 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
POLD3Q15054 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
POLD3Q15054 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
POLD3Q15054 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.7 ms