Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.64□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC-1.64□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC-1.64□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC-1.66□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC-1.67□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC-1.68□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC-1.68□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC-1.69□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-1.69□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC-1.69□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
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