Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARF1Q14162 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARF1Q14162 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARF1Q14162 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARF1Q14162 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARF1Q14162 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARF1Q14162 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARF1Q14162 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARF1Q14162 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARF1Q14162 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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