Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCINQ13939 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCINQ13939 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCINQ13939 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCINQ13939 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCINQ13939 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCINQ13939 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCINQ13939 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCINQ13939 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCINQ13939 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCINQ13939 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CCINQ13939 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CCINQ13939 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CCINQ13939 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CCINQ13939 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCINQ13939 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCINQ13939 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCINQ13939 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCINQ13939 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCINQ13939 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCINQ13939 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCINQ13939 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCINQ13939 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCINQ13939 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCINQ13939 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCINQ13939 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCINQ13939 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCINQ13939 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCINQ13939 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCINQ13939 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCINQ13939 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCINQ13939 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCINQ13939 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCINQ13939 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCINQ13939 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCINQ13939 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCINQ13939 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCINQ13939 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCINQ13939 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCINQ13939 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCINQ13939 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCINQ13939 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCINQ13939 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCINQ13939 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCINQ13939 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCINQ13939 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCINQ13939 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCINQ13939 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCINQ13939 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCINQ13939 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCINQ13939 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCINQ13939 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCINQ13939 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCINQ13939 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCINQ13939 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCINQ13939 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCINQ13939 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCINQ13939 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCINQ13939 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCINQ13939 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCINQ13939 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCINQ13939 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCINQ13939 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCINQ13939 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCINQ13939 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCINQ13939 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCINQ13939 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCINQ13939 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCINQ13939 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCINQ13939 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCINQ13939 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCINQ13939 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCINQ13939 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCINQ13939 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCINQ13939 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCINQ13939 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCINQ13939 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCINQ13939 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCINQ13939 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCINQ13939 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCINQ13939 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCINQ13939 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCINQ13939 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCINQ13939 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCINQ13939 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCINQ13939 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCINQ13939 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCINQ13939 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCINQ13939 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCINQ13939 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCINQ13939 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCINQ13939 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCINQ13939 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCINQ13939 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCINQ13939 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCINQ13939 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCINQ13939 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCINQ13939 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCINQ13939 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCINQ13939 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
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