Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CAPSQ13938 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
CAPSQ13938 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CAPSQ13938 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CAPSQ13938 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CAPSQ13938 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CAPSQ13938 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CAPSQ13938 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CAPSQ13938 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CAPSQ13938 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CAPSQ13938 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CAPSQ13938 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CAPSQ13938 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CAPSQ13938 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CAPSQ13938 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CAPSQ13938 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms