Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.04□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
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PTCH1Q13635 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
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PTCH1Q13635 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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PTCH1Q13635 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTCH1Q13635 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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