Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL4BQ13620 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL4BQ13620 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL4BQ13620 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL4BQ13620 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL4BQ13620 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL4BQ13620 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL4BQ13620 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL4BQ13620 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL4BQ13620 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL4BQ13620 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL4BQ13620 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL4BQ13620 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL4BQ13620 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL4BQ13620 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL4BQ13620 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL4BQ13620 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL4BQ13620 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL4BQ13620 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL4BQ13620 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL4BQ13620 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CUL4BQ13620 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CUL4BQ13620 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CUL4BQ13620 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CUL4BQ13620 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CUL4BQ13620 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CUL4BQ13620 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CUL4BQ13620 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CUL4BQ13620 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CUL4BQ13620 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CUL4BQ13620 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CUL4BQ13620 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CUL4BQ13620 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CUL4BQ13620 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CUL4BQ13620 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CUL4BQ13620 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CUL4BQ13620 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
CUL4BQ13620 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CUL4BQ13620 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CUL4BQ13620 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CUL4BQ13620 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
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