Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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