Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TCOF1Q13428 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
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