Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
KLF1Q13351 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KLF1Q13351 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KLF1Q13351 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KLF1Q13351 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KLF1Q13351 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KLF1Q13351 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KLF1Q13351 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KLF1Q13351 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KLF1Q13351 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KLF1Q13351 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KLF1Q13351 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KLF1Q13351 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KLF1Q13351 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
KLF1Q13351 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
KLF1Q13351 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
KLF1Q13351 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KLF1Q13351 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KLF1Q13351 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KLF1Q13351 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KLF1Q13351 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
KLF1Q13351 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KLF1Q13351 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KLF1Q13351 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
KLF1Q13351 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
KLF1Q13351 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KLF1Q13351 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KLF1Q13351 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KLF1Q13351 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KLF1Q13351 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KLF1Q13351 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KLF1Q13351 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KLF1Q13351 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KLF1Q13351 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
KLF1Q13351 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KLF1Q13351 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KLF1Q13351 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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