Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
ATMQ13315 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
ATMQ13315 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
ATMQ13315 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC-1.81□□□□□ -2.7
ATMQ13315 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
ATMQ13315 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
ATMQ13315 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
ATMQ13315 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
ATMQ13315 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
ATMQ13315 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
ATMQ13315 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
ATMQ13315 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
ATMQ13315 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
ATMQ13315 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
ATMQ13315 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
ATMQ13315 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
ATMQ13315 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
ATMQ13315 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
ATMQ13315 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
ATMQ13315 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
ATMQ13315 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
ATMQ13315 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
ATMQ13315 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
ATMQ13315 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
ATMQ13315 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
ATMQ13315 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-1.82□□□□□ -2.7
ATMQ13315 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC-1.82□□□□□ -2.7
ATMQ13315 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
ATMQ13315 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
ATMQ13315 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ATMQ13315 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ATMQ13315 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ATMQ13315 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-1.83□□□□□ -2.7
ATMQ13315 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ATMQ13315 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ATMQ13315 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ATMQ13315 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ATMQ13315 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ATMQ13315 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ATMQ13315 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ATMQ13315 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ATMQ13315 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ATMQ13315 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ATMQ13315 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ATMQ13315 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ATMQ13315 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ATMQ13315 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ATMQ13315 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ATMQ13315 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-1.83□□□□□ -2.7
ATMQ13315 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ATMQ13315 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ATMQ13315 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ATMQ13315 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
ATMQ13315 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.84□□□□□ -2.7
ATMQ13315 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
ATMQ13315 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
ATMQ13315 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
ATMQ13315 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC-1.84□□□□□ -2.7
ATMQ13315 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
ATMQ13315 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
ATMQ13315 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
ATMQ13315 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
ATMQ13315 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
ATMQ13315 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
ATMQ13315 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
ATMQ13315 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
ATMQ13315 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
ATMQ13315 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.7
ATMQ13315 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.7
ATMQ13315 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.7
ATMQ13315 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.7
ATMQ13315 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.7
ATMQ13315 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC-1.85□□□□□ -2.7
ATMQ13315 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.7
ATMQ13315 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.7
ATMQ13315 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
ATMQ13315 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
ATMQ13315 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
ATMQ13315 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
ATMQ13315 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
ATMQ13315 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
ATMQ13315 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
ATMQ13315 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
ATMQ13315 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
ATMQ13315 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
ATMQ13315 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
ATMQ13315 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
ATMQ13315 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.86□□□□□ -2.71
ATMQ13315 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
ATMQ13315 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
ATMQ13315 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
ATMQ13315 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
ATMQ13315 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
ATMQ13315 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
ATMQ13315 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
ATMQ13315 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
ATMQ13315 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC-1.87□□□□□ -2.71
ATMQ13315 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
ATMQ13315 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
ATMQ13315 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
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