Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CLN3Q13286 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CLN3Q13286 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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